Normalerweise genießt frau während der Schwangerschaft einen Kündigungsschutz, stimmt. Und soweit ich weiß gilt das auch für Auszubildende.
Denke aber, dass es am sinnvollsten wäre, wenn ihr euch beraten lassen könntet. Zum Beispiel bei der Arbeitnehmerkammer (D) oder der Arbeiterkammer (Ö). Möglicherweise kennen sich aber auch Beratungsstellen wie ProFamilia mit der Thematik aus.
Würde da an eurer Stelle einfach mal telefonisch oder per Mail Kontakt aufnehmen.